实验中心队伍成员包括主任、副主任、实验室主任、实验指导教师和实验员。实验中心主任全面负责中心的各项工作，中心副主任负责实验中心的规划建设、实验教学大纲的制订、队伍结构的安排、规章制度的制订、实验教师的工作考核。实验室主任负责实验室教学任务的安排，仪器设备的配置、实验内容的制订、实验室的规划。实验指导教师负责实验内容的落实、实验指导、批改实验报告、实验考核。实验员负责仪器设备的到位和维修、元器件的发放、实验室的安全卫生，协助指导部分实验。
实验中心现有专职、兼职人员共98名，其中包括主任1人，副主任4人，实验室主任12人，水上训练基地主任1人，创新基地主任1人，实验指导教师32人，兼职的学科带头人与骨干教师27人。从职称情况来看，在专职人员中有教授4人，副教授、高工、船长、轮机长13人，讲师、工程师、大副和大管轮等26人，有比较丰富的实验教学经验和合理的人员结构；从学位情况来看，博士学位8人，硕士学位15人，学士17人，学历层次比较高，并具备指导学生实验的丰富知识经验。专职人员平均年龄41岁，比较合理。从学科方向分布上来看，有航海、船艺、船舶通信导航、船舶主机、辅机、热能与动力工程、船舶电站、轮机自动化等各相关专业方向的指导老师。
在兼职教师中，有16名教授、博士生导师，均为学科带头人，主要把握3个市级重点学科和博士点的发展方向，指导“中心”的建设规划；26名副教授均为骨干教师，参与“中心”大型模拟教学设备的研制、实验教学和科研项目。
多名博士和硕士研究生承担着新的大型模拟教学设备的研制任务，参与实验教学辅导，每年从其中选拔1-2名较优秀的研究生留在“中心”工作，以提升“中心”实验教学队伍的整体素质。
实验中心形成了相对稳定的队伍结构模式，中心对专职担任实验教学工作的实验指导老师，特别是青年教师，给他们提供知识更新和深造的机会，包括和老教师结对、到兄弟院校的学习交流、到仪器设备厂家的参观、学习、培训，参加实验教学研讨会、提供攻读硕士、博士研究生的机会等措施，促进青年教师的成长。
对实验指导老师的考核，包括工作量、平时实验指导的态度、实验指导水平、学生评教、实验教改的想法和措施、发表实验研究论文等方面，形成优胜劣汰的考核机制。对新上岗的实验指导教师进行培训和考核，合格后才上岗，并由有经验的指导教师专门负责帮助指导，使其尽快适应实验教学的要求。