航海实验中心承担商船学院“航海技术”、“轮机工程”和“船舶电子电器”等3个航海类本科专业,“载运工具运用工程”、“交通信息工程及控制”和“轮机工程”3个硕士点,“载运工具运用工程”、“交通信息工程及控制”和“轮机工程”3个博士点的实验教学任务,以及驾驶员、轮机员培训任务。同时创新基地也承担了学生的创新工作,包括各类创新项目的申报、组织、实施,各级竞赛的组织。其中“航海技术”为国家级特色专业建设点,“轮机工程”为上海市特色专业建设点,“航海技术”和“轮机工程”为上海市本科教育高地,“交通信息工程及控制”和“载运工具运用工程”为上海市重点学科,“轮机工程”为上海市教委重点学科。航海实验中心共开设了50门实验课,实验项目数为319项,每年参加实验的学生人次数为9910人次,每年的实验人时数为38.4万人时。